另一种可能性,是来自另一组古人类的基因流把丹尼索瓦人的线粒体DNA带给“骨头坑”古人类或者它们的祖先。迄今为止,像这么古老的DNA仅在永冻土里发现过。该研究把我们对人类遗传进化学的了解,从晚更新世又向后推了大约20万年。位于西班牙阿塔波卡地区胡瑟裂谷(Sima de los Huesos)的这个洞穴,已经成为世界上最大的中更新世化石聚集地,迄今为止人们已经在这里发现28具骨骼化石,科学家或许可以通过它们进行更进一步的DNA提取工作。在过去的20多年里,由胡安-路易斯-阿苏亚加领导的古生物学家组成的一个西班牙科研组,一直在这里进行发掘工作,并把获得的骨骼拼接在一起。
这些化石被归类为海德堡人,但是它们也具备尼安德特人的一些典型特征。直到现在人们才有可能研究这些独特古人类的DNA。迈耶的科研组首次与马德里孔普鲁腾塞大学的古生物学教授胡安-路易斯-阿苏亚加合作,把他的方法应用到一个在“骨头坑”出土的洞熊身上,它比上面提到的大腿骨化石晚10万年,生活在大约30万年前。这项科研工作取得成功后,研究人员收集了在该洞发现的古人类大腿骨样本。并提取它的DNA,给线粒体DNA基因组排序,然后把这些远古遗传材料与尼安德特人、丹尼索瓦人、现代人和猿的进行对比。
德国马普进化人类学研究所所长萨凡特-巴伯教授说:“我们的研究结果显示,现在我们已经有能力研究已有几十万年历史的人类祖先的DNA。这为研究尼安德特人和丹尼索瓦人祖先的基因打开局面。这一发现极其振奋人心。”海德堡人于1907年首次在德国海德堡附近被发现,它们生活在非洲、欧洲和亚洲西部,这种人在大约25万年前消亡,它们的出现时间或许可以上溯到38万年前。男性身高可达大约5英尺9英寸(约合1.75米),女性身高可达5英尺2英寸(约合1.57米)。