实验室培养微生物
研究海洋微生物群落是非常具有挑战性的。在实验室里培育并观察微生物生态系统会改变微生物本身,且没有任何科学家可以预测它将如何改变。玻璃瓶里的条件与真实海洋里的完全不同,很可能玻璃瓶里的水包含更多食物。这将导致玻璃瓶里的微生物生长速度超过海洋里缓慢增长的微生物。
电子显微镜下的以氨为食的古生菌。
这也是实验室研究人员有时候会忽略自然界最常见微生物的原因之一。试图查明海洋里究竟是什么生物消耗了氨的科学家们也面临这一的问题。消耗氨的微生物可能非常常见,但它们生长的非常缓慢,生物学家何时才能培养足够多的实验室微生物以研究它们?桑托洛意外地解决了这一问题:那便是完全不理睬这些微生物,不给它们提供任何食物补充。
存活者
DNA测试显示大多数玻璃瓶里的微生物在无食物供给后18个月后消失了,存活下来的主要是缓慢生长的古生菌。初一咋看古生菌类似于细菌,它们大小相当,而且在显微镜中和细菌一样具有相同的圆形和棒形状。但古生菌是完全不同的有机体。
化学印记
海洋里产生的一氧化二氮具有罕见的化学印记。桑托洛想要测试她培育的古生菌是否也具有相匹配的化学印记,这将暗示它是这种气体的来源。某些元素的原子,例如氮和氧,都有所谓的轻和重的形式。海洋里产生的一氧化二氮具有这种“重”原子的罕见比例,科学家将其定义为它们的特征标记。每10万个氮原子里有369个、每10万个氧原子里有209个是“重的”。它们具有额外的中子。其它地方的氮和氧,例如地球大气层里,也具有少数重原子,但海洋里产生的一氧化二氮的重原子更加多。