他们认为，虽然城市建在一条有充足水源的河流岛上，却没有发现任何洪水灾害的痕迹。相反，种种迹象却表明这里曾经发生过一场大规模的火灾。其实，印度历史上曾经流传过远古时发生过一次奇特大爆炸的传说，许多“耀眼的光芒”、“无烟的大火”、“紫白色的极光”、“银色的云”、“奇异的夕阳”、“黑夜中的白昼”等等描述都可佐证核爆炸是致使古城毁灭的真凶。
两位学者分析了许多细节性的问题，尤其是废墟中大量烧熔的粘土和矿物碎片。在罗马大学和意大利国立研究会实验室进行的实验表明：它们被烧熔的温度高达 1400℃- 1500℃。在当时的生产力条件下，这么高的温度只可能在冶炼作坊的锻造炉内形成，而大量存在的烧熔粘土和矿物碎片是绝不可能在少数的锻造炉中形成的。
在“死丘”城还发现了不少爆炸的痕迹，他们找到了一个爆炸中心，中心地区的建筑物都夷为了平地。由这个中心向外，距离越远的地方毁坏程度就越小，而在最边缘的地区建筑物几乎完好无损。这和广岛原子弹爆炸后的景象十分相似。
这个假说有一个前提，那就是必须假定印度河流域的征服者已经掌握了原子能技术，这似乎很难使人相信。不过，在印度古代梵语叙事诗《摩呵婆罗多》中有一段关于战争的描写：“好像自然的威力一下子迸发了出来。太阳在旋转。武器的热焰使得大地熊熊燃烧。大象被火烧得狂奔，想躲避这可怕的灾难。河水沸腾，百兽死去，敌人一片片倒下，尸体狼藉。马和战车都被烧毁了，整个战场一片大火劫后的景象。海面上死一般的沉寂，起风了，大地亮了起来。这真是一幅令人毛骨悚然的画面，死者的尸体被可怕的大火烧得肢体不全，不复成形。我们从来没有见到过或听说过这样一种武器。”这可怕的场面使我们不能不把这种“秘密武器”同原子弹联系在一起。
如果真是这样，那么这些神秘的征服者又是谁呢?他们来自何方?他们会不会是来自宇宙的其他智慧生命呢?和地球上许多别的不解之谜一样，不少人坚信莫恒卓达罗城的覆灭和外星人有关。他们既然能够驾驶宇宙飞行器飞越广阔的星际空间来到地球，也就能够掌握原子能或更先进的技术。
另外，考古学家们在“死丘”只发现了少量的人体骨骼，那些失踪的居民会不会被外星人带走了呢?
也有人认为，在宇宙射线和电场的作用下.大气层中会形成一种化学性能非常活泼的微粒，这些微粒在磁场的作用下聚集在一起力之变得越来越大，从而形成许多.大小不等的球形“‘物理化学构成物”，形成这种构成物的同时还能产生大最的有毒物质。积累多了便会发生猛烈的爆炸:_随着爆炸开始，其他黑色闪电迅速引爆，从而形成类似核爆炸中的链式反应甲爆炸时的温度可高达1.5万度，足以把石头熔化。这个数字恰好与摩亨佐达罗遗址中的发掘物一致:据推测，摩亨佐达罗叮能是先被有毒空气袭击，继而又被猛烈的爆炸彻底摧毁。而在古城的大爆炸中，至少有3000团半径达30厘米的黑色闪电和1000多个球状闪电参与，因而爆炸威力无比。
还有人认为，摩亨佐达罗毁于外星“宇宙飞船”，英国学者捷文鲍尔特和意大利学者钦吉推测a万年前，一艘载着外星人的核动力飞船在印度上空游弋时，可能意外地发生了某种故障而引起爆炸，以至造成巨大灾难。然而外星人是否存在至今仍是一个未解之谜，故此说不足论。
“通古斯大爆炸”
近代史上还有一次著名的大爆炸，那就是俄国的“通古斯大爆炸”。通古斯大爆炸是1908年6月30日早上7时17分发生在俄罗斯西伯利亚中部的大爆炸，位置在北纬60.55度、东经101.57度，靠近通古斯河附近(今属俄罗斯联邦埃文基自治区)。摧折了超过2150平方公里内的6000万棵树。通古斯爆炸距今不远，爆炸现场人迹罕至，所以现场保存完好，事件发生不久，俄国和欧美的科学家就接踵而至，取证研究，一直不断。
在近百年的时间里，俄国、欧洲和美国的科学家反复实地考察并通过理论和实验研究了通古斯大爆炸的起因和性质，基本形成定
论。笔者仔细研究通古斯大爆炸大量的分析报告，发现通古斯的大爆炸与天启大爆炸极为相似。根据史料对两次爆炸的现象加以比较，可以推断天启大爆炸应是与通古斯大爆炸统属一类性质的天体闯入大气层在近地点的空中爆炸。爆炸的天外来物很可能是小彗星或彗星的碎片，不大可能是陨石。因为两个爆炸都没有发现陨石坑，而两个爆炸距地甚近，如是陨石，几乎不可能完全烧尽而不留残片。彗星的构成以碎石冰块为主，在爆炸时四溅消融，化之于无形。
