元谋老城乡大那乌村的元谋人遗址 资料图片
当代天问，必称四大谜：宇宙如何起源？地球从何而来？生物因何而生？人类何时而人？且不说宇宙、地球缘起，与云南多少有些干系：那生命、人类起源，关键之地肯定在云南。滇中抚仙湖畔有帽天山，5.3亿年前的寒武纪生命大爆炸之谜就藏在此山之中；禄丰川街老长箐村旁有“恐龙公墓”，埋藏着2亿年前恐龙起源和灭亡之谜；而在元谋坝子边缘上那蚌村后， 170万年前原始人类起源之谜又被定格在紫色山坡之上。
有这三大生命之谜垫底，照叶树林文化起源之谜、华夏文化起源之谜、稻作文化起源之谜、铜鼓文化起源之谜、茶文化起源之谜等等，关键之地全锁定在云南。还有最救命的玉米、最可爱的熊猫，刨根究底，那起源之谜，都与云南有关。
华夏文明的起源地是不是云南？
在传统的中国历史著作中，华夏文明乃至东亚文明的起源地在黄河中、下游一带。到20世纪后期，国内外都有学者提出，华夏文明还另有源头。
云南省测绘局地图制图工程师扶永发用“以水定山”的方法去解读古代奇书《山海经》，经过长期跋山涉水实地考察和研究论证，写出《山海经新探》一书，提出古代云南是华夏文明的原始发祥地。《山海经》中的“昆仑山”与今天滇西横断山脉地形十分吻合，古轩辕国地和炎、黄、舜、禹的葬地都在滇西，“大禹治水”治的是虎跳峡以上的金沙江河道。商汤之时，八次迁都，华夏民族才从今天的云南迁入中原，并把滇西山名、河名和炎、黄、尧、舜、禹等先祖的行迹和葬地名称也“随迁”到了中原。
有学者认为，扶永余对《山海经》的诠释仅仅是一种大胆的推论，要得出最后的结论，还必须有更多的证据和考古支持。
中国人起源于境内同一个人种？
在云南发现的元谋人化石距今已有170万年，是中国之最。不少学者主张，中国现代人的祖先就是元谋人和北京人。他们认为，在中国发现的各期人类化石都有相似的特点。据此判断，中国人起源于中国境内的同一个人种，祖宗当然是年代最早的元谋人。
但是，近年又有学者根据现代遗传学研究得出结论：中国人的祖先和全球现代人一样，都是“非洲人”，迁徙到亚洲大陆的时间是10万年到20万年前。而元谋人的后代在现代人形成之前就由于某种原因灭绝了。这些学者使用的现代技术有DNA、Y染色体测定等，言之凿凿，让人难以反驳。
但也有学者认为，现代人的起源不会是一个单一的过程，不能断言现代人起源于非洲或起源于某个其他地区。由此又引发了新的争论：人类祖先是单系的还是多系的？人类进化是单元的还是多元的？至今没有结论。
最早走进云南的中原“圣人”是王羲之还是孔子？
据《元史》记载，元代以前，“云南未知尊孔子”，而“祀王羲之为先师”！直到元初，才在大理“首建孔子庙”，云南才开始尊孔圣。南诏、大理自古信佛，庙里立的泥人都是佛，这下换了孔子，滇人一时不习惯，都说这回拜的是“汉佛”(李京《云南志略》)！
有学者考证说，唐代南诏贵族子弟多到内地学习书法，而唐代内地最推崇的就是王羲之。于是王羲之就成了祖师爷，甚至“立庙祀右军将军王羲之为圣人”（《南诏野史》）。元人李京认为，这就是“云南尊王羲之，不知尊孔孟”的原因(《云南志》)。按《旧唐书》记载，南诏归唐之后，把贵族子弟送到成都做人质，剑南节度韦臬把这些公子全送进学校，只学书法、算术，不学儒学，公子们自然只知“王圣”，不知“孔圣”。
