7月18日，清军增援部队两次试图登陆，均被狙击于黑龙江中。20日，精奇里江地区被俄军完全控制，败阵的清军退回瑷珲，当地华人居民亦躲藏起来。阿穆尔哥萨克骑兵团击败清军后，并未急于进攻，而是转入加固海兰泡城防工事，并为渡江攻击瑷珲城做准备。
7月20日当天，阿穆尔哥萨克部队少将格里勃斯基对哥萨克部队颁布命令，号召哥萨克各部队做好战斗准备，随时准备击退清军的一切军事行动。他还在命令中张狂地叫嚣：“我们要让哥萨克的名字响彻满洲，成为中国百姓一场可怕的灾难！”
此后，哥萨克军队成为军事挑衅的罪魁祸首。史料显示，7月22日，72名哥萨克军人在炮兵连的掩护下，冲击中方边境，袭击中国哨所，杀死中国守军，点燃弹药库，抢夺枪支。28日，16名哥萨克士兵，袭击了一艘载着20名中国官兵的小船，哥萨克先用枪打，之后跳上船去，将未死的人全部砍头。
后来得知，死者中包括义和团首领袁任(译音)，他在当地被誉为“义和团之魂”，那天他前来边防的目的是准备与清军首领共商抗俄大计。从7月21日至28日，俄国哥萨克奉命破坏了黑龙江中方一侧的全部界桩。
至7月底之前，俄国军队为发动总攻做好了准备，并在28日之前，完成了对中国黑河屯周边道路、沟谷极为周密的军事侦察。那时，黑龙江将军寿山组织东北军民抵抗俄国进犯，部署瑷珲副都统风翔防御北路，呼伦贝尔副都统伊兴阿驻守海拉尔防守西路，通肯副都统庆棋驻伊兰防备东路。镇守黑河屯的是瑷珲副都统风翔麾下的镇边新军右路统领崇昆山的3个营。
据《黑河史话》介绍，《瑷珲条约》签署后，中俄边贸开放，黑河屯住户增加到百余户。黑河屯除了鳞次栉比的百余间房舍，还有庙宇、衙门、商铺和电报局。7月30日，俄军扎波尔斯基大尉率领60人骑兵，半夜绕行进入黑河屯，侦察清军布防。返回后，扎波尔斯基立即向阿穆尔军区汇报说，清军的战壕主要修建在五道壑洛至小河黑一线，兵力驻扎主要分布在精奇里江河口对岸的小黑河，扼守梅尔甘至齐齐哈尔的通路。
